Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTAP49354 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTAP49354 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTAP49354 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNTAP49354 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNTAP49354 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNTAP49354 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNTAP49354 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FNTAP49354 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FNTAP49354 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTAP49354 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTAP49354 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTAP49354 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNTAP49354 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNTAP49354 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTAP49354 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTAP49354 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTAP49354 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTAP49354 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTAP49354 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTAP49354 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTAP49354 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTAP49354 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTAP49354 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTAP49354 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTAP49354 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTAP49354 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTAP49354 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTAP49354 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTAP49354 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTAP49354 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTAP49354 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTAP49354 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTAP49354 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTAP49354 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTAP49354 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTAP49354 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTAP49354 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTAP49354 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTAP49354 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTAP49354 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTAP49354 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNTAP49354 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNTAP49354 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNTAP49354 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNTAP49354 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNTAP49354 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FNTAP49354 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNTAP49354 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTAP49354 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTAP49354 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTAP49354 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTAP49354 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTAP49354 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTAP49354 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTAP49354 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTAP49354 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTAP49354 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTAP49354 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTAP49354 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTAP49354 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTAP49354 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTAP49354 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTAP49354 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTAP49354 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTAP49354 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTAP49354 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTAP49354 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTAP49354 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNTAP49354 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNTAP49354 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTAP49354 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTAP49354 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTAP49354 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTAP49354 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTAP49354 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTAP49354 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTAP49354 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTAP49354 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTAP49354 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTAP49354 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTAP49354 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms