Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPIAP49247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPIAP49247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPIAP49247 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPIAP49247 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPIAP49247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPIAP49247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPIAP49247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPIAP49247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPIAP49247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPIAP49247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPIAP49247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPIAP49247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPIAP49247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPIAP49247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPIAP49247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPIAP49247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPIAP49247 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPIAP49247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPIAP49247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPIAP49247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPIAP49247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPIAP49247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPIAP49247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPIAP49247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPIAP49247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPIAP49247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPIAP49247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPIAP49247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPIAP49247 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPIAP49247 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPIAP49247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPIAP49247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPIAP49247 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPIAP49247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPIAP49247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPIAP49247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPIAP49247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPIAP49247 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPIAP49247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPIAP49247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPIAP49247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPIAP49247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPIAP49247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPIAP49247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPIAP49247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPIAP49247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPIAP49247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPIAP49247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPIAP49247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPIAP49247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms