Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX2P48378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX2P48378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX2P48378 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX2P48378 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX2P48378 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX2P48378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX2P48378 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX2P48378 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX2P48378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX2P48378 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX2P48378 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX2P48378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX2P48378 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX2P48378 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX2P48378 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX2P48378 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX2P48378 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX2P48378 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX2P48378 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX2P48378 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX2P48378 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX2P48378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX2P48378 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX2P48378 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX2P48378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX2P48378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX2P48378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX2P48378 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX2P48378 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX2P48378 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX2P48378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX2P48378 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX2P48378 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX2P48378 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX2P48378 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX2P48378 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX2P48378 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX2P48378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX2P48378 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX2P48378 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX2P48378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX2P48378 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX2P48378 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX2P48378 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RFX2P48378 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RFX2P48378 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX2P48378 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX2P48378 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX2P48378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX2P48378 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX2P48378 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX2P48378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX2P48378 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX2P48378 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX2P48378 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX2P48378 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX2P48378 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX2P48378 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX2P48378 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX2P48378 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX2P48378 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX2P48378 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX2P48378 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX2P48378 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX2P48378 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX2P48378 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX2P48378 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX2P48378 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX2P48378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX2P48378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX2P48378 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX2P48378 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX2P48378 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX2P48378 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX2P48378 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX2P48378 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX2P48378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX2P48378 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX2P48378 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX2P48378 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX2P48378 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms