Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RECQLP46063 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQLP46063 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQLP46063 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQLP46063 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQLP46063 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQLP46063 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQLP46063 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQLP46063 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQLP46063 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQLP46063 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQLP46063 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQLP46063 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQLP46063 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQLP46063 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQLP46063 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQLP46063 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQLP46063 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQLP46063 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQLP46063 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQLP46063 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQLP46063 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQLP46063 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQLP46063 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQLP46063 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQLP46063 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQLP46063 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQLP46063 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQLP46063 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQLP46063 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQLP46063 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQLP46063 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQLP46063 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RECQLP46063 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RECQLP46063 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RECQLP46063 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RECQLP46063 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RECQLP46063 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RECQLP46063 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RECQLP46063 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RECQLP46063 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RECQLP46063 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RECQLP46063 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RECQLP46063 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RECQLP46063 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RECQLP46063 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RECQLP46063 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RECQLP46063 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RECQLP46063 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RECQLP46063 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RECQLP46063 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RECQLP46063 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RECQLP46063 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RECQLP46063 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RECQLP46063 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RECQLP46063 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RECQLP46063 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RECQLP46063 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms