Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP5P45974 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP5P45974 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP5P45974 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP5P45974 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP5P45974 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP5P45974 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP5P45974 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP5P45974 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP5P45974 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP5P45974 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP5P45974 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP5P45974 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP5P45974 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP5P45974 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP5P45974 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP5P45974 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP5P45974 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP5P45974 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
USP5P45974 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP5P45974 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP5P45974 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP5P45974 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP5P45974 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP5P45974 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP5P45974 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP5P45974 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP5P45974 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP5P45974 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP5P45974 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP5P45974 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP5P45974 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP5P45974 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP5P45974 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP5P45974 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
USP5P45974 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP5P45974 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP5P45974 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP5P45974 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP5P45974 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP5P45974 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP5P45974 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP5P45974 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP5P45974 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP5P45974 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP5P45974 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP5P45974 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP5P45974 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP5P45974 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
USP5P45974 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP5P45974 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP5P45974 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
USP5P45974 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP5P45974 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP5P45974 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP5P45974 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP5P45974 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP5P45974 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP5P45974 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
USP5P45974 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP5P45974 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP5P45974 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP5P45974 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP5P45974 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP5P45974 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP5P45974 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP5P45974 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP5P45974 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP5P45974 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP5P45974 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP5P45974 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP5P45974 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP5P45974 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP5P45974 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP5P45974 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
USP5P45974 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP5P45974 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP5P45974 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP5P45974 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP5P45974 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP5P45974 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms