Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA4P43694 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA4P43694 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA4P43694 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA4P43694 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA4P43694 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA4P43694 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA4P43694 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA4P43694 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA4P43694 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA4P43694 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATA4P43694 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATA4P43694 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATA4P43694 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATA4P43694 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATA4P43694 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATA4P43694 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATA4P43694 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATA4P43694 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATA4P43694 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATA4P43694 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA4P43694 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA4P43694 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA4P43694 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA4P43694 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA4P43694 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA4P43694 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATA4P43694 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATA4P43694 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA4P43694 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA4P43694 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA4P43694 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA4P43694 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA4P43694 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA4P43694 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA4P43694 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA4P43694 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA4P43694 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA4P43694 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA4P43694 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA4P43694 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA4P43694 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA4P43694 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA4P43694 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA4P43694 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA4P43694 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA4P43694 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA4P43694 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GATA4P43694 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GATA4P43694 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA4P43694 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA4P43694 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GATA4P43694 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA4P43694 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA4P43694 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms