Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL35P42766 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL35P42766 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL35P42766 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL35P42766 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL35P42766 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL35P42766 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL35P42766 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL35P42766 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL35P42766 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL35P42766 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL35P42766 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL35P42766 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL35P42766 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL35P42766 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL35P42766 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL35P42766 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL35P42766 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL35P42766 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL35P42766 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL35P42766 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL35P42766 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL35P42766 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL35P42766 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL35P42766 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL35P42766 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL35P42766 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL35P42766 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL35P42766 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL35P42766 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
RPL35P42766 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL35P42766 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL35P42766 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL35P42766 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL35P42766 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL35P42766 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL35P42766 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL35P42766 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL35P42766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL35P42766 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL35P42766 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL35P42766 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL35P42766 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL35P42766 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL35P42766 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL35P42766 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL35P42766 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL35P42766 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL35P42766 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL35P42766 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL35P42766 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL35P42766 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL35P42766 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL35P42766 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL35P42766 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL35P42766 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL35P42766 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL35P42766 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL35P42766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL35P42766 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL35P42766 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL35P42766 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms