Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARL4AP40617 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARL4AP40617 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ARL4AP40617 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARL4AP40617 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms