Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ITGAEP38570 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ITGAEP38570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ITGAEP38570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ITGAEP38570 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ITGAEP38570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms