Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGCXP38435 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGCXP38435 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGCXP38435 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGCXP38435 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGCXP38435 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGCXP38435 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGCXP38435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGCXP38435 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGCXP38435 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGCXP38435 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGCXP38435 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGCXP38435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGCXP38435 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGCXP38435 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGCXP38435 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGCXP38435 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GGCXP38435 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGCXP38435 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGCXP38435 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GGCXP38435 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGCXP38435 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGCXP38435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGCXP38435 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGCXP38435 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGCXP38435 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGCXP38435 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGCXP38435 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGCXP38435 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGCXP38435 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGCXP38435 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGCXP38435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGCXP38435 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGCXP38435 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGCXP38435 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGCXP38435 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGCXP38435 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGCXP38435 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGCXP38435 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGCXP38435 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGCXP38435 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGCXP38435 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGCXP38435 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGCXP38435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGCXP38435 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGCXP38435 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGCXP38435 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGCXP38435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGCXP38435 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGCXP38435 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GGCXP38435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGCXP38435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGCXP38435 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGCXP38435 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGCXP38435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGCXP38435 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GGCXP38435 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GGCXP38435 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms