Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF1P36956 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SREBF1P36956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SREBF1P36956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SREBF1P36956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SREBF1P36956 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms