Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYLC1P35663 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYLC1P35663 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLC1P35663 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms