Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDIT3P35638 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDIT3P35638 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDIT3P35638 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDIT3P35638 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms