Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COPB2P35606 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPB2P35606 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPB2P35606 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPB2P35606 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPB2P35606 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPB2P35606 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPB2P35606 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPB2P35606 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPB2P35606 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPB2P35606 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPB2P35606 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPB2P35606 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COPB2P35606 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COPB2P35606 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COPB2P35606 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COPB2P35606 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COPB2P35606 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COPB2P35606 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COPB2P35606 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COPB2P35606 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COPB2P35606 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COPB2P35606 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COPB2P35606 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COPB2P35606 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COPB2P35606 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COPB2P35606 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COPB2P35606 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
COPB2P35606 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COPB2P35606 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COPB2P35606 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COPB2P35606 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COPB2P35606 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COPB2P35606 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COPB2P35606 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COPB2P35606 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COPB2P35606 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COPB2P35606 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COPB2P35606 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COPB2P35606 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COPB2P35606 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COPB2P35606 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COPB2P35606 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COPB2P35606 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COPB2P35606 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COPB2P35606 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COPB2P35606 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COPB2P35606 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPB2P35606 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPB2P35606 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPB2P35606 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPB2P35606 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPB2P35606 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPB2P35606 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPB2P35606 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPB2P35606 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COPB2P35606 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPB2P35606 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COPB2P35606 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COPB2P35606 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COPB2P35606 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPB2P35606 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPB2P35606 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPB2P35606 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPB2P35606 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPB2P35606 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPB2P35606 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COPB2P35606 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPB2P35606 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPB2P35606 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPB2P35606 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COPB2P35606 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPB2P35606 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPB2P35606 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPB2P35606 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPB2P35606 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPB2P35606 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPB2P35606 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPB2P35606 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPB2P35606 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPB2P35606 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPB2P35606 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPB2P35606 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPB2P35606 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPB2P35606 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPB2P35606 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPB2P35606 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPB2P35606 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPB2P35606 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPB2P35606 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPB2P35606 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPB2P35606 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COPB2P35606 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPB2P35606 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms