Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN1P35523 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLCN1P35523 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLCN1P35523 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN1P35523 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms