Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS2P35354 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS2P35354 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGS2P35354 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS2P35354 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms