Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPDP35247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPDP35247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms