Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF2P35227 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF2P35227 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF2P35227 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms