Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTF4P34130 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTF4P34130 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTF4P34130 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTF4P34130 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTF4P34130 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTF4P34130 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTF4P34130 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTF4P34130 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF4P34130 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF4P34130 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF4P34130 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF4P34130 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF4P34130 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTF4P34130 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTF4P34130 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTF4P34130 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTF4P34130 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTF4P34130 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTF4P34130 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTF4P34130 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTF4P34130 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTF4P34130 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTF4P34130 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTF4P34130 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTF4P34130 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTF4P34130 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF4P34130 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF4P34130 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF4P34130 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF4P34130 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF4P34130 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTF4P34130 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTF4P34130 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTF4P34130 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTF4P34130 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTF4P34130 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTF4P34130 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTF4P34130 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTF4P34130 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTF4P34130 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTF4P34130 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTF4P34130 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTF4P34130 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NTF4P34130 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTF4P34130 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTF4P34130 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTF4P34130 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTF4P34130 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTF4P34130 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTF4P34130 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTF4P34130 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTF4P34130 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTF4P34130 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTF4P34130 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTF4P34130 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTF4P34130 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTF4P34130 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTF4P34130 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTF4P34130 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTF4P34130 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTF4P34130 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTF4P34130 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTF4P34130 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTF4P34130 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTF4P34130 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms