Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC12P31275 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC12P31275 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms