Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA11P31270 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXA11P31270 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA11P31270 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA11P31270 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms