Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA9P31269 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA9P31269 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA9P31269 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA9P31269 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA9P31269 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA9P31269 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA9P31269 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA9P31269 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA9P31269 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms