Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP5DP30049 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP5DP30049 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP5DP30049 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP5DP30049 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP5DP30049 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP5DP30049 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms