Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTR1EP28566 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1EP28566 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1EP28566 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms