Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALRP27797 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALRP27797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALRP27797 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALRP27797 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALRP27797 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALRP27797 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALRP27797 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALRP27797 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALRP27797 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALRP27797 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALRP27797 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALRP27797 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALRP27797 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALRP27797 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALRP27797 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALRP27797 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALRP27797 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALRP27797 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALRP27797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALRP27797 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALRP27797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALRP27797 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALRP27797 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALRP27797 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALRP27797 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALRP27797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALRP27797 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALRP27797 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALRP27797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALRP27797 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALRP27797 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALRP27797 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALRP27797 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALRP27797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CALRP27797 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALRP27797 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALRP27797 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALRP27797 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALRP27797 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALRP27797 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALRP27797 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALRP27797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALRP27797 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALRP27797 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALRP27797 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALRP27797 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALRP27797 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALRP27797 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALRP27797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALRP27797 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALRP27797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALRP27797 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALRP27797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALRP27797 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALRP27797 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALRP27797 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALRP27797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALRP27797 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALRP27797 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALRP27797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALRP27797 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALRP27797 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALRP27797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALRP27797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALRP27797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALRP27797 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALRP27797 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALRP27797 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALRP27797 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms