Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MARK3P27448 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARK3P27448 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARK3P27448 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARK3P27448 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK3P27448 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK3P27448 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK3P27448 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK3P27448 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK3P27448 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK3P27448 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK3P27448 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK3P27448 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARK3P27448 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARK3P27448 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARK3P27448 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK3P27448 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK3P27448 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK3P27448 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK3P27448 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK3P27448 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MARK3P27448 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARK3P27448 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MARK3P27448 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK3P27448 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK3P27448 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK3P27448 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK3P27448 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK3P27448 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK3P27448 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK3P27448 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK3P27448 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK3P27448 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK3P27448 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK3P27448 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARK3P27448 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MARK3P27448 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARK3P27448 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARK3P27448 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARK3P27448 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARK3P27448 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MARK3P27448 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MARK3P27448 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MARK3P27448 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK3P27448 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARK3P27448 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARK3P27448 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARK3P27448 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARK3P27448 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARK3P27448 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MARK3P27448 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK3P27448 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK3P27448 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARK3P27448 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARK3P27448 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARK3P27448 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARK3P27448 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARK3P27448 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARK3P27448 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARK3P27448 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARK3P27448 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARK3P27448 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MARK3P27448 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARK3P27448 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARK3P27448 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARK3P27448 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MARK3P27448 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARK3P27448 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK3P27448 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK3P27448 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK3P27448 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK3P27448 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK3P27448 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK3P27448 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARK3P27448 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARK3P27448 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARK3P27448 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARK3P27448 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms