Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL13P26373 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL13P26373 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL13P26373 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL13P26373 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPL13P26373 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPL13P26373 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPL13P26373 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL13P26373 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL13P26373 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL13P26373 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL13P26373 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPL13P26373 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPL13P26373 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL13P26373 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL13P26373 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL13P26373 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL13P26373 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL13P26373 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL13P26373 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPL13P26373 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPL13P26373 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPL13P26373 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPL13P26373 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPL13P26373 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPL13P26373 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPL13P26373 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPL13P26373 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPL13P26373 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPL13P26373 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPL13P26373 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPL13P26373 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPL13P26373 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPL13P26373 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPL13P26373 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPL13P26373 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPL13P26373 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPL13P26373 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPL13P26373 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPL13P26373 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPL13P26373 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPL13P26373 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPL13P26373 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPL13P26373 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPL13P26373 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPL13P26373 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPL13P26373 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPL13P26373 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPL13P26373 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPL13P26373 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPL13P26373 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPL13P26373 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPL13P26373 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPL13P26373 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPL13P26373 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPL13P26373 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPL13P26373 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPL13P26373 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPL13P26373 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPL13P26373 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPL13P26373 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPL13P26373 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPL13P26373 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPL13P26373 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPL13P26373 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPL13P26373 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPL13P26373 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPL13P26373 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPL13P26373 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPL13P26373 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPL13P26373 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPL13P26373 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms