Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTX3P26022 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTX3P26022 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTX3P26022 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTX3P26022 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTX3P26022 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTX3P26022 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTX3P26022 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTX3P26022 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTX3P26022 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTX3P26022 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTX3P26022 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTX3P26022 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTX3P26022 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTX3P26022 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTX3P26022 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTX3P26022 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTX3P26022 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTX3P26022 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTX3P26022 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTX3P26022 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTX3P26022 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTX3P26022 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTX3P26022 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTX3P26022 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTX3P26022 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTX3P26022 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTX3P26022 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTX3P26022 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTX3P26022 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTX3P26022 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTX3P26022 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTX3P26022 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTX3P26022 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTX3P26022 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTX3P26022 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTX3P26022 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTX3P26022 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTX3P26022 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTX3P26022 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTX3P26022 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTX3P26022 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTX3P26022 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTX3P26022 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTX3P26022 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTX3P26022 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTX3P26022 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTX3P26022 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTX3P26022 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTX3P26022 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTX3P26022 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTX3P26022 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTX3P26022 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTX3P26022 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTX3P26022 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTX3P26022 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTX3P26022 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTX3P26022 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTX3P26022 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTX3P26022 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTX3P26022 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms