Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCHP24723 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCHP24723 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCHP24723 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms