Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5F1P24539 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5F1P24539 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP5F1P24539 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms