Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV1-2P23083 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV1-2P23083 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV1-2P23083 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV1-2P23083 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms