Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALB2P22676 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALB2P22676 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALB2P22676 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALB2P22676 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB2P22676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB2P22676 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB2P22676 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALB2P22676 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALB2P22676 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CALB2P22676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB2P22676 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB2P22676 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB2P22676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB2P22676 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB2P22676 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB2P22676 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB2P22676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB2P22676 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB2P22676 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB2P22676 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB2P22676 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB2P22676 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB2P22676 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB2P22676 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB2P22676 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB2P22676 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB2P22676 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB2P22676 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB2P22676 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB2P22676 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB2P22676 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB2P22676 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB2P22676 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB2P22676 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB2P22676 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB2P22676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB2P22676 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB2P22676 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB2P22676 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB2P22676 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB2P22676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB2P22676 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB2P22676 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB2P22676 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB2P22676 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB2P22676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB2P22676 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB2P22676 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB2P22676 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB2P22676 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB2P22676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB2P22676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB2P22676 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB2P22676 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB2P22676 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB2P22676 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms