Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA1P21709 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA1P21709 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA1P21709 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA1P21709 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA1P21709 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA1P21709 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA1P21709 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA1P21709 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA1P21709 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA1P21709 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA1P21709 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA1P21709 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA1P21709 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA1P21709 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA1P21709 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA1P21709 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA1P21709 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms