Protein–RNA interactions for Protein: P21549

AGXT, Serine--pyruvate aminotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGXTP21549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGXTP21549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGXTP21549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGXTP21549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGXTP21549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGXTP21549 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGXTP21549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGXTP21549 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGXTP21549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGXTP21549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGXTP21549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGXTP21549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGXTP21549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGXTP21549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGXTP21549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGXTP21549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGXTP21549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGXTP21549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGXTP21549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGXTP21549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGXTP21549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGXTP21549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGXTP21549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGXTP21549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms