Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BPBP20851 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C4BPBP20851 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BPBP20851 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BPBP20851 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BPBP20851 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BPBP20851 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BPBP20851 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4BPBP20851 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C4BPBP20851 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4BPBP20851 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4BPBP20851 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C4BPBP20851 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4BPBP20851 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BPBP20851 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms