Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LMNB1P20700 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
LMNB1P20700 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB1P20700 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
LMNB1P20700 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms