Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA2P20248 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA2P20248 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNA2P20248 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms