Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2EP19388 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2EP19388 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2EP19388 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2EP19388 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms