Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB1P18505 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB1P18505 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB1P18505 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB1P18505 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms