Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBPP18428 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBPP18428 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBPP18428 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBPP18428 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBPP18428 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBPP18428 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBPP18428 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBPP18428 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBPP18428 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBPP18428 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBPP18428 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBPP18428 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBPP18428 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBPP18428 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBPP18428 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBPP18428 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBPP18428 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBPP18428 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBPP18428 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBPP18428 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBPP18428 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBPP18428 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBPP18428 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBPP18428 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBPP18428 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBPP18428 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBPP18428 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBPP18428 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBPP18428 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBPP18428 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBPP18428 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBPP18428 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBPP18428 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBPP18428 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBPP18428 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBPP18428 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBPP18428 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBPP18428 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LBPP18428 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBPP18428 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LBPP18428 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBPP18428 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBPP18428 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBPP18428 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBPP18428 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBPP18428 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBPP18428 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBPP18428 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBPP18428 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LBPP18428 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBPP18428 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBPP18428 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBPP18428 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBPP18428 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBPP18428 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms