Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DESP17661 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DESP17661 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DESP17661 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DESP17661 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DESP17661 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DESP17661 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DESP17661 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DESP17661 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DESP17661 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DESP17661 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DESP17661 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DESP17661 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DESP17661 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DESP17661 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DESP17661 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DESP17661 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DESP17661 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DESP17661 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DESP17661 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DESP17661 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DESP17661 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DESP17661 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DESP17661 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DESP17661 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DESP17661 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DESP17661 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DESP17661 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DESP17661 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DESP17661 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DESP17661 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DESP17661 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DESP17661 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DESP17661 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DESP17661 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DESP17661 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DESP17661 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DESP17661 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DESP17661 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DESP17661 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DESP17661 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DESP17661 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DESP17661 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DESP17661 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DESP17661 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DESP17661 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DESP17661 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DESP17661 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DESP17661 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DESP17661 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DESP17661 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DESP17661 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DESP17661 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DESP17661 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DESP17661 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DESP17661 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DESP17661 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DESP17661 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DESP17661 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DESP17661 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DESP17661 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DESP17661 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DESP17661 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DESP17661 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DESP17661 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DESP17661 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DESP17661 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DESP17661 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DESP17661 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DESP17661 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms