Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGAP17050 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGAP17050 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGAP17050 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGAP17050 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGAP17050 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAGAP17050 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAGAP17050 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGAP17050 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGAP17050 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGAP17050 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGAP17050 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGAP17050 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGAP17050 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGAP17050 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGAP17050 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGAP17050 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGAP17050 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGAP17050 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGAP17050 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGAP17050 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGAP17050 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGAP17050 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGAP17050 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGAP17050 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGAP17050 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGAP17050 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGAP17050 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGAP17050 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGAP17050 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGAP17050 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGAP17050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGAP17050 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGAP17050 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGAP17050 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGAP17050 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGAP17050 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGAP17050 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGAP17050 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGAP17050 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGAP17050 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGAP17050 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGAP17050 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGAP17050 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAGAP17050 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAGAP17050 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGAP17050 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAGAP17050 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAGAP17050 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAGAP17050 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAGAP17050 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAGAP17050 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAGAP17050 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAGAP17050 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms