Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF43P17038 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF43P17038 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF43P17038 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms