Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRAP16234 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRAP16234 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRAP16234 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms