Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSPP15924 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSPP15924 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DSPP15924 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSPP15924 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSPP15924 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSPP15924 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSPP15924 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSPP15924 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSPP15924 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSPP15924 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSPP15924 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSPP15924 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSPP15924 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSPP15924 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSPP15924 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSPP15924 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSPP15924 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSPP15924 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSPP15924 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSPP15924 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSPP15924 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSPP15924 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSPP15924 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSPP15924 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSPP15924 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DSPP15924 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DSPP15924 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSPP15924 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSPP15924 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSPP15924 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSPP15924 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSPP15924 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSPP15924 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSPP15924 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSPP15924 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSPP15924 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSPP15924 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSPP15924 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSPP15924 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSPP15924 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSPP15924 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSPP15924 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSPP15924 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DSPP15924 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSPP15924 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSPP15924 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSPP15924 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSPP15924 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSPP15924 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSPP15924 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSPP15924 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSPP15924 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSPP15924 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSPP15924 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSPP15924 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSPP15924 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSPP15924 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSPP15924 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSPP15924 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSPP15924 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSPP15924 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DSPP15924 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSPP15924 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms