Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-EP13747 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-EP13747 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-EP13747 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms