Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CFTRP13569 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CFTRP13569 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CFTRP13569 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CFTRP13569 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CFTRP13569 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CFTRP13569 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CFTRP13569 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CFTRP13569 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CFTRP13569 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CFTRP13569 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
CFTRP13569 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CFTRP13569 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CFTRP13569 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CFTRP13569 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CFTRP13569 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CFTRP13569 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CFTRP13569 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CFTRP13569 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CFTRP13569 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CFTRP13569 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CFTRP13569 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CFTRP13569 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CFTRP13569 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CFTRP13569 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CFTRP13569 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CFTRP13569 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CFTRP13569 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CFTRP13569 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CFTRP13569 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CFTRP13569 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CFTRP13569 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CFTRP13569 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CFTRP13569 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CFTRP13569 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
CFTRP13569 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CFTRP13569 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CFTRP13569 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CFTRP13569 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CFTRP13569 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CFTRP13569 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CFTRP13569 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CFTRP13569 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
CFTRP13569 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CFTRP13569 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
CFTRP13569 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
CFTRP13569 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CFTRP13569 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CFTRP13569 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CFTRP13569 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
CFTRP13569 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CFTRP13569 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CFTRP13569 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CFTRP13569 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CFTRP13569 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CFTRP13569 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CFTRP13569 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
CFTRP13569 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CFTRP13569 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CFTRP13569 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CFTRP13569 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CFTRP13569 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CFTRP13569 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CFTRP13569 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CFTRP13569 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CFTRP13569 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CFTRP13569 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CFTRP13569 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
CFTRP13569 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CFTRP13569 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CFTRP13569 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
CFTRP13569 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CFTRP13569 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CFTRP13569 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CFTRP13569 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CFTRP13569 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CFTRP13569 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CFTRP13569 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CFTRP13569 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CFTRP13569 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CFTRP13569 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CFTRP13569 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CFTRP13569 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CFTRP13569 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CFTRP13569 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CFTRP13569 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFTRP13569 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CFTRP13569 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
CFTRP13569 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CFTRP13569 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CFTRP13569 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CFTRP13569 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CFTRP13569 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CFTRP13569 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CFTRP13569 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms