Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL2P13500 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL2P13500 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL2P13500 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL2P13500 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL2P13500 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL2P13500 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL2P13500 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL2P13500 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL2P13500 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL2P13500 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL2P13500 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL2P13500 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL2P13500 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL2P13500 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL2P13500 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL2P13500 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL2P13500 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL2P13500 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL2P13500 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL2P13500 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL2P13500 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL2P13500 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL2P13500 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL2P13500 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL2P13500 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL2P13500 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL2P13500 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL2P13500 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL2P13500 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL2P13500 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL2P13500 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL2P13500 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL2P13500 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL2P13500 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL2P13500 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL2P13500 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL2P13500 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL2P13500 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL2P13500 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL2P13500 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL2P13500 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL2P13500 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL2P13500 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms