Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms