Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2C1P13056 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR2C1P13056 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2C1P13056 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms