Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ACTN1P12814 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACTN1P12814 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTN1P12814 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN1P12814 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN1P12814 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms